| ゼッケン | 都道府県 | 学校・クラブ（男子） | 学校・クラブ（女子） |
| 1 | 北海道 | 旭川市立神居東中学校 | 美幌町立北中学校 |
| 2 | 青森 | MUTSUKATSU陸上クラブ | MUTSUKATSU陸上クラブ |
| 3 | 岩手 | 花巻市立花巻北中学校 | 遠野市立遠野中学校 |
| 4 | 宮城 | 富谷市立東向陽台中学校 | 仙台市立八木山中学校 |
| 5 | 秋田 | 秋田大学教育文化学部附属中学校 | 大館市立東中学校 |
| 6 | 山形 | 山形市立第五中学校 | 山形市立第十中学校 |
| 7 | 福島 | 猪苗代町立猪苗代中学校 | 田村市立船引中学校 |
| 8 | 茨城 | 小美玉市立美野里中学校 | 筑西市立下館南中学校 |
| 9 | 栃木 | 那須塩原市立西那須野中学校 | 那須塩原市立三島中学校 |
| 10 | 群馬 | 群馬県立中央中等教育学校 | 前橋市立荒砥中学校 |
| 11 | 埼玉 | 鶴ヶ島市立藤中学校 | さいたま市立常盤中学校 |
| 12 | 千葉 | 我孫子市立我孫子中学校 | 香取市立小見川中学校 |
| 13 | 東京 | あきる野市立西中学校 | 江戸川区立清新第一中学校 |
| 14 | 神奈川 | 茅ヶ崎市立第一中学校 | 藤沢市立鵠沼中学校 |
| 15 | 山梨 | 南アルプス市立櫛形中学校 | 南アルプス市立櫛形中学校 |
| 16 | 新潟 | 小千谷市立小千谷中学校 | 十日町市立南中学校 |
| 17 | 長野 | ＩＳジュニア駅伝クラブ | 三陽陸上クラブ |
| 18 | 富山 | 富山市立速星中学校 | 富山市立大沢野中学校 |
| 19 | 石川 | 金沢学院大学附属中学校 | 金沢学院大学附属中学校 |
| 20 | 福井 | 福井市足羽第一中学校 | 越前市武生第一中学校 |
| 21 | 静岡 | 浜松市立細江中学校 | 浜松市立細江中学校 |
| 22 | 愛知 | 大口町立大口中学校 | 豊川市立西部中学校 |
| 23 | 三重 | 川越町立川越中学校 | 四日市市立山手中学校 |
| 24 | 岐阜 | KJAC | 高山市立日枝中学校 |
| 25 | 滋賀 | 大津市立唐崎中学校 | 大津市立粟津中学校 |
| 26 | 京都 | 京都市立桂中学校 | 京都光華中学校 |
| 27 | 大阪 | 豊能町立吉川中学校 | 和泉市立北池田中学校 |
| 28 | 兵庫 | 姫路市立山陽中学校 | 洲本市立青雲中学校 |
| 29 | 奈良 | 奈良市立二名中学校 | 奈良市立二名中学校 |
| 30 | 和歌山 | 白浜町立白浜中学校 | 那智勝浦町立下里中学校 |
| 31 | 鳥取 | 八頭町立八頭中学校 | 八頭町立八頭中学校 |
| 32 | 島根 | 出雲市立向陽中学校 | 益田市立益田中学校 |
| 33 | 岡山 | 岡山市立京山中学校 | 岡山市立京山中学校 |
| 34 | 広島 | 坂町立坂中学校 | 熊野町立熊野東中学校 |
| 35 | 山口 | 防府市立国府中学校 | 防府市立国府中学校 |
| 36 | 香川 | 土庄町立土庄中学校 | 高松市立龍雲中学校 |
| 37 | 徳島 | つるぎ町立貞光中学校 | 三好市立三野中学校 |
| 38 | 愛媛 | 新居浜市立南中学校 | 新居浜市立南中学校 |
| 39 | 高知 | 香南市立香我美中学校 | 高知県立安芸中学校 |
| 40 | 福岡 | 行橋市立中京中学校 | 飯塚市立穂波西中学校 |
| 41 | 佐賀 | 伊万里市立啓成中学校 | 多久市立東原庠舎中央校 |
| 42 | 長崎 | 対馬市立雞知中学校 | 西彼陸友会 |
| 43 | 熊本 | 宇城市立松橋中学校 | 宇城市立松橋中学校 |
| 44 | 大分 | 豊後高田市立高田中学校 | 豊後高田市立高田中学校 |
| 45 | 宮崎 | 宮崎市立大淀中学校 | 延岡市立岡富中学校 |
| 46 | 鹿児島 | さつま町立宮之城中学校 | 神村学園中等部 |
| 47 | 沖縄 | 名護市立名護中学校 | 豊見城市立豊見城中学校 |
| 48 | 開催地 | 甲賀市立水口中学校 | 守山市立守山南中学校 |
出場校